ג׳ובאני דוס סנטוס הגיע למחלקת הנוער של ברצלונה ממקסיקו והתקדם לבארסה ב׳. הוא בן למשפחת כדורגל: אחיו ג׳ונתן שיחק גם הוא במועדון, ואביו זיזיניו היה שחקן מקצועני.

בעונת 2007/08 השתלב בבוגרת של רייקארד, בתקופה שבה שיחקו בה רונאלדיניו, מסי, אטו והנרי. הוא הגיע אחרי הצלחות בנבחרות הצעירות של מקסיקו, ובהן זכייה במונדיאל עד גיל 17.

ג׳ובאני הגיע ממשפחת כדורגל: אביו זיזיניו היה שחקן, ואחיו ג׳ונתן עבר גם הוא בבארסה. ההצלחה עם נבחרת מקסיקו הצעירה והעלייה דרך מחלקת הנוער יצרו ציפיות גדולות. התקופה הקצרה בבוגרים הקדימה קריירה ארוכה יותר באנגליה, בספרד ובצפון אמריקה.

ב־2008 עבר לטוטנהאם ובהמשך שיחק בין היתר במאיורקה ובוויאריאל. הפרק בבוגרת של בארסה היה קצר, אך הוא נשאר חלק מסיפור השחקנים המקסיקנים שצמחו במועדון והמשיכו לקריירה בינלאומית.